荧光滤光片广泛应用于生化分析邻域，荧光滤光片一般包含三片组合，即激发滤光片、二色镜和发射滤光片。      

激发滤光片（Exciting Filter, Exciter Filter,Excitation Filter )：在荧光显微镜中，只有激发荧光的波长可通过的滤光片。也有直接使用激光作为激发光。      

二色镜（Dichroic Mirror,Dichroic Beamsplitter,Dichromatic Beamsplitter）：又称二向色滤光片或分色镜。与显微镜的光路呈45°角放置。这片滤光片反射一种颜色光（激发光）并且透射另一种颜色光（发射光），激发光的反射率大于90%，发射光的透射率大于90%。光谱中不能透过的部分被反射而不是被吸收。滤光片在透射光和反射光下的颜色互为补色，因而又称二向色滤光片。      

发射滤光片（Emitting Filter,Emission Filter ,Barrier Filter，Emitter)：选择并传输样本发出的荧光，其他范围光线截止。发射光的波长比激发光的波长要长。可以选择带通滤光片或者长波通滤光片作为发射滤光片。       

常用的有与635nm激发波长680nm发射波长配套的635nm高反射率675nm~730nm高透过率的二色镜和中心波长680nm截止深度OD5的窄带滤光片，由于激发光采用的是氦氖激光器（波长为632.8nm），免去了激发滤光片。